True、Falseを数値に置き換えするなら、

＝(A1＝B1)*1
または
＝(A1＝B1)/1

True は “1”　, False は”0″ ですから、
オートフィルタ▼ のプルダウンの中に “0”　がなければ、A列=B列はすべてOKです。